NDKmol - molecular viewer 0.97

O NDKmol - molecular viewer

NDKmol -- Przeglądarka molekularna dla Androida == Informacje == NDKmol jest molekularną przeglądarką dla Androida. Można zobaczyć trójwymiarowe struktury białek, kwasów nukleinowych i małych cząsteczek. NDKmol obsługuje większość typowych reprezentacji dla cząsteczek, takich jak wstążka, ślad, kij, kula i linia. NDKmol wspiera również operacje symetrii; mogą być wyświetlane zespoły biologiczne i opakowania kryształowe. Możesz wyszukiwać i pobierać struktury z RCSB PDB i NCBI Pubchem. NDKmol ma prawie taką samą funkcjonalność jak GLmol, który jest napisany w WebGL/Javascript i działa w przeglądarkach internetowych. Możesz spróbować GLmol w http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Cechy == * Odczyt pliku PDB lub SDF / MOL * Obracanie / Tłumaczenie / Zoom modelu przez palec * Reprezentacje - Linia - Kij - Kula(promień van der Waals) - Ślad węglowy alfa - Wstążka (cienka lub gruba) - Wątek - Rurka współczynnika B - Drabina kwasu nukleinowego - Linia kwasu nukleinowego - rozpuszczalnikowe "gwiazdy" * Wygładzanie beta-arkuszy * Kolorowanki - Według łańcucha - Według struktury pomocniczej (po zdefiniowaniu w rekordach ARKUSZA/HELIX) - Według elementów - Gradacja (vel łuk łańcucha) - Współczynnik B - polarny/niebiegunowy * Krystalografia - Komórka jednostki wyświetlacza - Pokaż opakowanie kryształowe (po zdefiniowaniu w sekcji UWAGA) - Wyświetlanie zespołu biologicznego (po zdefiniowaniu w sekcji UWAGA) == Jak używać == Po uruchomieniu NDKmol automatycznie ładuje Porin (PDBID: 2POR) jako przykład. Możesz obrócić cząsteczkę palcem. Aby powiększyć lub przetłumaczyć cząsteczkę, naciśnij przycisk MENU w telefonie/tablecie i wybierz tryb. Obsługiwane są również gesty dwoma palcami. Wszystko inne można zrobić z menu. Aby załadować inne pliki PDB, umieść plik w katalogu "PDB" karty SD i wybierz polecenie "Otwórz" w MENU. Można również pobrać struktury bezpośrednio z RCSB PDB i NCBI PubChem serwera sieci web. Wybierz "Szukaj i pobierz" w menu. == Kontakt == Strona internetowa projektu znajduje się pod adresem http://webglmol.sourceforge.jp/ . Kody źródłowe tego programu można uzyskać tutaj. Komentarze i sugestie są mile widziane na http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ lub [email protected] === POWIADOMIENIE O LICENCJI === NDKmol jest licencjonowany na licencji GNU Lesser General Public License w następujący sposób. Jednak pliki PDB zawarte jako przykłady są w różnych warunkach. Prosimy o skonsultowanie się z http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Przeglądarka molekularna dla Androida (C) Prawa autorskie 2011, biochem_fan Ten program jest wolnym oprogramowaniem: można go rozpowszechniać i/lub modyfikować zgodnie z warunkami GNU Lesser General Public License opublikowaną przez fundacji Wolnego Oprogramowania, w wersji 3 Licencji, lub (do twojej dyspozycji) dowolną późniejszą wersję. Ten program jest rozprowadzany w nadziei, że będzie to przydatne, ale bez żadnej gwarancji; nawet bez dorozumianej gwarancji HANDLOWEJ LUB PRZYDATNOŚCI DO OKREŚLONEGO CELU. Zobacz GNU Lesser General Public License, aby uzyskać więcej informacji. Powinieneś był otrzymać kopię GNU Lesser General Public License