NDKmol - molecular viewer 0.97

Licencji: Wolna ‎Rozmiar pliku: 688.13 KB
‎Ocena użytkowników: 3.0/5 - ‎1 ‎Głosów

NDKmol -- Przeglądarka molekularna dla Androida == Informacje == NDKmol jest molekularną przeglądarką dla Androida. Można zobaczyć trójwymiarowe struktury białek, kwasów nukleinowych i małych cząsteczek. NDKmol obsługuje większość typowych reprezentacji dla cząsteczek, takich jak wstążka, ślad, kij, kula i linia. NDKmol wspiera również operacje symetrii; mogą być wyświetlane zespoły biologiczne i opakowania kryształowe. Możesz wyszukiwać i pobierać struktury z RCSB PDB i NCBI Pubchem. NDKmol ma prawie taką samą funkcjonalność jak GLmol, który jest napisany w WebGL/Javascript i działa w przeglądarkach internetowych. Możesz spróbować GLmol w http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html == Cechy == * Odczyt pliku PDB lub SDF / MOL * Obracanie / Tłumaczenie / Zoom modelu przez palec * Reprezentacje - Linia - Kij - Kula(promień van der Waals) - Ślad węglowy alfa - Wstążka (cienka lub gruba) - Wątek - Rurka współczynnika B - Drabina kwasu nukleinowego - Linia kwasu nukleinowego - rozpuszczalnikowe "gwiazdy" * Wygładzanie beta-arkuszy * Kolorowanki - Według łańcucha - Według struktury pomocniczej (po zdefiniowaniu w rekordach ARKUSZA/HELIX) - Według elementów - Gradacja (vel łuk łańcucha) - Współczynnik B - polarny/niebiegunowy * Krystalografia - Komórka jednostki wyświetlacza - Pokaż opakowanie kryształowe (po zdefiniowaniu w sekcji UWAGA) - Wyświetlanie zespołu biologicznego (po zdefiniowaniu w sekcji UWAGA) == Jak używać == Po uruchomieniu NDKmol automatycznie ładuje Porin (PDBID: 2POR) jako przykład. Możesz obrócić cząsteczkę palcem. Aby powiększyć lub przetłumaczyć cząsteczkę, naciśnij przycisk MENU w telefonie/tablecie i wybierz tryb. Obsługiwane są również gesty dwoma palcami. Wszystko inne można zrobić z menu. Aby załadować inne pliki PDB, umieść plik w katalogu "PDB" karty SD i wybierz polecenie "Otwórz" w MENU. Można również pobrać struktury bezpośrednio z RCSB PDB i NCBI PubChem serwera sieci web. Wybierz "Szukaj i pobierz" w menu. == Kontakt == Strona internetowa projektu znajduje się pod adresem http://webglmol.sourceforge.jp/ . Kody źródłowe tego programu można uzyskać tutaj. Komentarze i sugestie są mile widziane na http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ lub [email protected] === POWIADOMIENIE O LICENCJI === NDKmol jest licencjonowany na licencji GNU Lesser General Public License w następujący sposób. Jednak pliki PDB zawarte jako przykłady są w różnych warunkach. Prosimy o skonsultowanie się z http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Przeglądarka molekularna dla Androida (C) Prawa autorskie 2011, biochem_fan Ten program jest wolnym oprogramowaniem: można go rozpowszechniać i/lub modyfikować zgodnie z warunkami GNU Lesser General Public License opublikowaną przez fundacji Wolnego Oprogramowania, w wersji 3 Licencji, lub (do twojej dyspozycji) dowolną późniejszą wersję. Ten program jest rozprowadzany w nadziei, że będzie to przydatne, ale bez żadnej gwarancji; nawet bez dorozumianej gwarancji HANDLOWEJ LUB PRZYDATNOŚCI DO OKREŚLONEGO CELU. Zobacz GNU Lesser General Public License, aby uzyskać więcej informacji. Powinieneś był otrzymać kopię GNU Lesser General Public License

historia wersji

  • Wersja 0.97 opublikowany na 2018-03-25
    Poprawiono pobieranie PDB z RCSB PDB
  • Wersja 0.95 opublikowany na 2015-05-02
    Wersja 0.95 (20150503),* Stała "Szukaj PubChem&do pracy z najnowszą aktualizacją serwera,* Mam nadzieję, że ta wersja powinna działać na Androidzie 5. (Testowane w Androidzie 5.1 na Nexusie 7), Jeśli nie, proszę o przesłanie mi szczegółów.,* Można otworzyć pliki map MRC (BETA), Dla użytkowników urządzeń bez przycisku MENU:,powinien istnieć sposób, aby otworzyć MENU, na przykład, naciskając, przycisk HOME długo. Zapoznaj się z instrukcją obsługi urządzenia.
  • Wersja 0.92 opublikowany na 2013-07-02
    Kilka poprawek i aktualizacji

Szczegóły programu